Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms