Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms