Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms