Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms