Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms