Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms