Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms