Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc163A2AGD7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms