Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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