Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm16A2A935 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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