Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pramef6A2A8M8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pramef6A2A8M8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pramef6A2A8M8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pramef6A2A8M8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pramef6A2A8M8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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