Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrit3W8DXL4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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