Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms