Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms