Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms