Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sumo3Q9Z172 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sumo3Q9Z172 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sumo3Q9Z172 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms