Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms