Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms