Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms