Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms