Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms