Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms