Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chrac1Q9JKP8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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