Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nectin1Q9JKF6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nectin1Q9JKF6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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