Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cnga3Q9JJZ8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms