Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms