Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms