Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms