Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms