Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp2aQ9DB34 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp2aQ9DB34 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Chmp2aQ9DB34 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Chmp2aQ9DB34 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Chmp2aQ9DB34 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Chmp2aQ9DB34 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Chmp2aQ9DB34 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Chmp2aQ9DB34 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Chmp2aQ9DB34 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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