Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310002L09RikQ9D7L5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310002L09RikQ9D7L5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms