Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl40Q9D783 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms