Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Borcs6Q9D6W8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Borcs6Q9D6W8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Borcs6Q9D6W8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms