Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rab11fip1Q9D620 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rab11fip1Q9D620 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rab11fip1Q9D620 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rab11fip1Q9D620 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rab11fip1Q9D620 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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