Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc81Q9D5W4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms