Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms