Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms