Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms