Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pus10Q9D3U0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms