Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Hddc3Q9D114 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hddc3Q9D114 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hddc3Q9D114 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hddc3Q9D114 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hddc3Q9D114 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hddc3Q9D114 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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