Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms