Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf146Q9CZW6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf146Q9CZW6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf146Q9CZW6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf146Q9CZW6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf146Q9CZW6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf146Q9CZW6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms