Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms