Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp2Q9CUU3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms