Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms