Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQC3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQC3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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