Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc5Q9CQA1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms