Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms