Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms