Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NsmfQ99NF2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms